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绘制阿拉比卡咖啡地图!

雀巢专家开发新数据库以更好地识别更具气候适应性的咖啡作物

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绘制阿拉比卡咖啡地图!

随着气候变化威胁到咖啡种植业,雀巢专家正在探索如何利用先进的数据科学和人工智能来帮助选择和培育更具气候适应性的作物。

虽然咖啡有120多个品种,但全球咖啡产量中约70%是阿拉比卡咖啡。阿拉比卡咖啡对于升温的耐受性较低,比其他咖啡品种(如罗布斯塔)更容易受到疾病的影响。此外,由于气候变化,适合咖啡种植的可耕地面积正在减少,产量也因水资源短缺而显著降低。

为了确保咖啡种植业的可持续发展,并保障和改善民生,雀巢植物科学家正在探索具有更高产量、更具抗病抗旱能力的新型阿拉比卡咖啡品种。

作为这项工作的一部分,专家们利用先进的数据科学方法开发了一个非常高质量的阿拉比卡咖啡参考基因组。这个参考基因组可以在公开的数字数据库中获取,从而能更好地分析出具有更多产量、更大的果实、更强的抗病抗旱能力,以及风味或香气特性等具体特征的咖啡品种。

雀巢农业科学研究所所长Jeroen Dijkman表示:“简单来说,我们的新参考基因组就像一张高质量的城市地图。它将帮助我们在阿拉比卡咖啡基因组中识别出含有成年植物特定特征的关键遗传标记。这将有助于我们的植物科学家和其他专家更好地识别、选择和培育新的改良阿拉比卡咖啡品种。”

这个参考基因组代表了植物研究领域的重大进展。这项创新成果近期已在具有高影响力的科学期刊《自然遗传学》上发表。 雀巢研究部门的基因学高级专家Patrick Descombes是该论文的合著者之一,他表示:“虽然已经存在其他阿拉比卡咖啡的公共参考基因组,但我们团队的工作质量非常高。我们使用了最先进的基因组学方法,包括长读长和短读长高通量测序 ,创建了一个先进、完整和连续的阿拉比卡咖啡参考基因组。”

这项工作是与法国可持续发展国家研究院共同开展的,并与全球联盟中的几个学术合作伙伴进行了合作,其中包括新加坡南洋理工大学、巴西圣保罗大学、美国布法罗大学、乌干达国家农业研究组织、芬兰赫尔辛基大学、德国莱比锡大学、美国博伊斯·汤普森研究所和康奈尔大学,以及比利时VIB-UGent植物系统生物学中心。

雀巢的植物育种工作已经初见成效。公司正在与其主要采购地的农民合作,种植由其植物科学专家开发的优良咖啡品种。仅在2022年,雀巢咖啡2030计划就已经分发了超过600万株幼苗。